Joan Jordán recaló en el Sevilla FC en julio de 2019 por catorce millones de euros, tras dos muy buenas temporadas en el Eibar. En ellas, demostró su polivalencia y ser un mediocampista box to box capaz de sostener al conjunto eibarrés. El catalán contó desde el principio con la confianza de Julen Lopetegui, consolidándose en el once inicial. Su temprano estreno goleador ante Granada CF y Deportivo Alavés ayudó en su asentamiento.  En esta primera temporada, el gerundense fue uno de los pesos pesados del vestuario, levantando su primer título como sevillista, la UEFA Europa League.

Joan Jordán y el Sevilla FC

Durante la temporada 20-21 y la 21-22 siguió siendo uno de los fijos en un Sevilla aún establecido en puestos de UEFA Champions League. Sin embargo, en el curso 2022-23, tras un gran cambio estructural en la plantilla, los resultados empeoraron. Joan no logró rehacerse y, entre críticas, lesiones y suplencias; el catalán perdió su hueco en el once titular. A pesar de las dudas, el Sevilla consiguió ganar su séptima Europa League. A pesar de esto, Jordán solo pudo aportar un gol frente al Fenerbahçe en las primeras rondas, teniendo un paso desapercibido en cuanto a participación por aquel Sevilla FC. En la campaña 2023-24, Joan Jordán empeoró incluso su situación con numerosas lesiones y suplencias. Esos tiempos difíciles dieron pie a su salida.

Su paso por Mendizorroza

Tras varias temporadas de inestabilidad y pocos minutos, Joan Jordán partió cedido al Alavés en busca de continuidad a finales del mercado de verano de la temporada 2024-25.  El jugador comenzó a sumar tiempo de juego pronto y estrenó titularidad en la victoria (2-1) ante el propio Sevilla FC. Bajo la dirección de Luis García Plaza, disputó 27 partidos, 17 de ellos como titular. Consiguió buenos números, anotando la cantidad de 5 goles y 2 asistencias, contribuyendo al objetivo de la salvación. Estas buenas estadísticas empezaron a dar argumentos a los sevillistas para estar de acuerdo con su regreso a Nervión en el siguiente curso.

La vuelta de Jordán

El futbolista de 31 años se reincorporó a las filas nervionenses en julio de 2025. No obstante, el regreso del catalán se vio truncado por una operación de hernia discal y hasta noviembre no pudo ser convocado. Después de varios partidos citado, participó de nuevo ante el Extremadura el en Copa del Rey. Volvió a contar con minutos el pasado domingo, en el enfrentamiento de la jornada 15 de LaLiga entre Sevilla y Valencia en Mestalla.

Ante el conjunto che, Joan Jordán sumó su partido 200 con el Sevilla FC. Además, el cuadro rojiblanco es el equipo con el que más encuentros ha disputado. En su estancia en la capital andaluza, ha anotado 7 goles y asistido en 13 ocasiones. Matías Almeyda sustituyó a Peque por Jordán en el minuto 81, pero el Valencia consiguió empatar en el minuto 93, finalizando así el partido.

Ahora, el mediocampista, con las numerosas bajas con las que cuenta el Sevilla FC, tiene la oportunidad de sumar continuidad poco a poco en el centro del campo y conseguir un hueco en el once titular.